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谷歌发布新模型 AlphaGenome,一次可读取 100 万个 DNA 碱基,对生物学研究有何影响?
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这个国内还不火,但在海外已经登上Hacker News几乎榜首了,我来说说怎么回事吧。
快速理解这个研究把过去只能“局部放大看”的 DNA 序列,直接一次读 100 万个碱基,然后在单碱基分辨率上同时预测 11 类调控特性(启动子、增强子活性、RNA 产量、剪接位点、染色质可及性等),再用同一个模型给出任意突变的功能影响评分。
1 Mb 长上下文意味着调控区 + 目标基因可以一起送进模型,避免了原先窗口切分带来的“看得到却连不上”的…。
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